全面渗透在学校教育的全过程中。包括学科教学、各项教育活动、班主任工作等。
一方面与原有思想品德课、思想政治课及青春期教育等相关教学内容有机结合进行；一方面可利用活动课、班团队活动，举办心理健康教育的专题讲座。
开展心理咨询和心理辅导。
建立学校和家庭心理健康教育沟通的渠道，优化家庭教育环境。
心理健康教育的师资队伍和条件保障
教师心理健康水平提高的重要途径就是——培训。通过培训，一方面取得证书，另一方面还要有从事专职心理咨询（辅导）教师资格认证。否则，专业知识和实际能力达不到要求的，绝不能随意安排做专职心理咨询教师。同时还要加强心理健康辅导设备的研发，心理健康课教案工具箱的普及。
心理健康教育的组织领导：由省、自治区、直辖市教育行政部门德育处或基（普）教处负责中小学心理健康教育工作。时间从2000年秋季开学起，大中城市有条件的中小学要逐步开展心理健康教育。小城镇及农村的中小学也要从实际出发，逐步创造条件开展心理健康教育。 （原文3800多字） 《教育部文件》教基[1999]3号
如何在学校中开展心理健康教育
1.重视教师自身素质的提高
教师自身的素质直接决定其教育行为。只有掌握关于儿童青少年心理发展的科学知识、按照科学的规律和方法开展教育工作、处理学生日常表现出的心理行为问题和意外事件，教师才能真正做到将心理健康教育落在实处，才能真正促进学生心理健康的发展。如，一位平时表现还不错的、身心都很健康的学生，由于一时的冲动偷拿了同学的钱，事后良心的自责使他找到老师并承认了错误。但由于教师处理不当，他从此被戴上了小偷的帽子，父母的责骂、教师的不屑和同学的疏远，使他心理背上了沉重的负担，从此郁郁寡欢、自暴自弃，不但学习成绩下降，而且变得怕和人打交道，甚至出现幻听、幻视，总怀疑别人在背后议论他又在偷东西，最终发展到再也无法上学，陷入心理危机。而有同样经历的另一位学生，在承认错误的时候得到了老师的谅解，老师不但没有将事态扩大，而且还把信任和改正的机会给他，把管理班费的任务教给了他。在老师的不断鼓励和积极支持下，这位学生终于摆脱了上次错误在心灵上留下的阴影，能抬起头走路、堂堂正正地坦然处理关于钱的问题，其它方面的发展不但没受到消极影响，反而因老师的谅解和信任所带来的自尊、自信的增强而得到促进。
可见，教师作为教育实施的主体，其自身的素质对开展心理健康教育起着举足轻重的影响。很难想象，自身心理健康水平低、对心理健康教育缺乏科学认识的教师，可以培养出具有良好心理素质的学生。所以，重视教师自身素质的提高是真正深入、有效开展学校心理健康教育的前提和保障。
2.注重与学校日常的教育教学活动相结合
目前，不少的学校虽然也认识到了心理健康教育的重要性，但却机械、简单地将之理解为课程教育或开展一、两次轰轰烈烈的活动。孰不知，真正的心理健康教育和良好心理素质的培养绝不是每周一、两节课或者搞几次活动就能实现的。事实上，大量的研究与实践经验都表明，心理健康教育和其它的教育一样需要与学校日常的教育教学活动相结合，需要“润物细无声”的意识和观念；良好心理素质的培养仅靠有限的时间、空间是难以实现的，同样需要在点滴的生活实践经验中积累而成。因此，学校日常的教育教学活动应成为心理健康教育的主渠道，只有将心理健康教育的思想、内容渗透到教师每天大量而具体教育教学工作中去，才能把心理健康教育真正做到实处。实践证明，只要充分发挥教师自身的主动性、能动性和创造性，鼓励教师开动脑筋、注意积累、重视交流，完全可以将心理健康教育与学校日常的教育教学活动融合在一起，其教育效果也将非常显著，同时会对学校日常的教育教学活动带来巨大的促进。
3.注重实践，突出以活动为主的特点
研究与实践证明，实现心理健康教育更多地依赖于个体在真实情境中的实践操作与体验。因此，心理健康教育不能成为一门说教课，不能只停留在口头上，而应深入生活、在实践中加以训练、巩固。为此，我们倡导注重实践，给学生机会，让学生在参与中、在“做”中真正受到心理健康教育。其中，最主要和最直接的实现方式就是在心理健康教育中突出以活动为主的特点，寓心理健康教育于活动之中，不仅在活动中蕴涵、传递有关心理健康教育的知识，还注意在日常的教育教学实践中随时抓住问题作为教育契机开展生动、直观的心理健康教育活动，并注重在生活中有意识地组织学生开展各种活动去实践、体验所学的心理健康教育知识等等。通过这些生动、活泼、有趣的活动，不仅让学生受到实实在在的心理健康教育，而且使学生体会到心理健康教育来源于生活、实践于生活的基本道理，从而将心理健康教育再一次真正落在实处。
4.注重家长与社会力量的参与，共同推进心理健康教育
除了学校教育，学生心理健康的发展还受到其它社会因素的制约。其中，家长作为学生成长与发展中的重要他人，家长关于心理健康教育的认识和观念将直接影响学生心理健康的发展和学校心理健康教育的开展。这在一些学校组织的意在锻炼学生心理素质、促进学生心理健康发展的手拉手夏令营或者少年军校的活动被塞满高级食物的书包和每隔三两天一次的探望搞得变了味道的教育现状中得到充分体现。除此之外，各种社会现象、社会舆论、影视文化与传媒等其它社会因素也直接影响着学生心理健康的发展和学校心理健康教育的开展。可见，心理健康教育不仅仅是学校教育的任务，也是全社会的任务和职责；心理健康教育只有得到社会的支持和认可，才能得到真正开展。也就是说，学校开展心理健康教育时应注重调动全社会的力量，获得来自社会的支持和认可，首先应获得来自家长的支持和认可。因此，我们提出，学校开展心理健康教育时必须注重与家长达成共识，通过各种活动与宣传，打破家长那种认为只要学习好就是发展得好的旧观念、旧框框，帮助家长建立现代的、科学的人才观，获得家长的支持和认同，鼓励家长参与，创设出全体成员共同参与和支持心理健康教育的环境与氛围，从而使心理健康教育扎扎实实地开展下去。
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