心理健康教育主要是通过以下途径来完成的：
一、开设以讲授为主的有关课程
开设心理学课、心理卫生课、心理健康教育课或举办有关的知识讲座，向学生传授、普及心理健康方面的有关知识，对于帮助学生正确认识自己、有效地调控自己的心理和行为无疑是有必要的。在开展心理健康教育工作初期，这种方式也比较易于为教师所掌握。但从解决学生身上存在着的实际问题来说，其作用还是有限的。因为心理健康教育的作用不仅是要扩展学生的知识，而且还要改善学生情绪状态、转变其态度、养成必要的社会技能等，所有这些单靠知识传授是难以奏效的。
二、开设心理健康教育活动课
这是为开展心理健康教育而专门设计的一种活动课程，一般都列入教学计划之中。其特点在于：形式上以学生活动为主，内容选取上充分考虑学生的实际需要，活动组织上以教学班为单位，活动课的目的、内容、方法、程序均是有计划、有系统地安排设计的。通过这一途径开展心理健康教育的好处是：在专门组织的活动中可以对学生的认知、情感、态度、行为各方面有目的地施加积极的影响；学生参与活动，有利于发挥自己的主动性；以教学班为活动单位便于组织管理，且能使班级全体学生在心理健康教育活动中受益；将心理健康教育列入课程，也使这项工作的开展在人员、时间上有了保证，因此比较正规。只是如何在班级活动中考虑每个学生具体情况，实行个别化对待，则是要认真解决的问题。
三、结合班级、团队活动开展心理健康教育
不把心理健康教育作为一门课程单独开出、列入课程计划，而是结合班会活动、课外活动、团队活动来进行，是这一途径的特点。新生入学时的“始业辅导”、毕业时的升学辅导也属于这一类。其有利的一面是能把心理健康教育与班级、团队活动以及学校安排的其他例行活动结合在一起，便于发挥这几项工作在统一的育人活动中的整体功能。但要注意的是，心理健康教育仍须有自身的目标和内容，不要让心理健康教育被班级、团队的日常活动所代替而丧失自己的特色。
四、在学科教学中渗透心理健康教育
学习辅导是心理健康教育的重要方面，它主要是结合学科教学来进行的。
学习是学生的主导活动，学生大量的心理困扰都产生于学习过程中，理应在教学过程得到满意地解决。实际上各科教材中蕴含有不少适用于心理健康教育的内容素材，教学过程中还会经常出现有利于实施心理健康教育的教育情境。教师只要细心挖掘、善加利用，一定可收到心理健康教育的实效。近年来，已有中小学教师在语文、数学、思想品德、社会等科目教学中尝试渗透心理健康教育，取得了一些成功的经验。
五、个别辅导
个别辅导是辅导教师通过与学生一对一的沟通互动来实现的专业助人活动，比较常用的方式有个别交谈、电话咨询、信函咨询、个案研究等。有些小学开展的“知心姐姐信箱”活动，就是信函咨询的一种形式。个案研究是针对个别学生（通常是一些特殊学生包括资质优异学生、情绪困扰学生、行为偏差学生、家庭处境不利的学生等）所实施的一种比较深入的、持续时间较长的个别辅导方式。它要求广泛地收集资料，客观地分析问题的性质与成因，依据诊断的结果，拟定辅导方案，以协助学生解决问题。由于心理辅导的精髓在于个别化对待，因此可以说个别辅导是一种不可替代的辅导方式。一所学校在开展心理健康教育时无论以什么途径为主，如果不以个别辅导相配合，则其心理健康教育工作都是不完整的。
六、小组辅导
小组辅导也称团体咨询，是一组学生在辅导教师指导下讨论训练并有效地处理他们所面临的共同问题。小组人数少则四五人，多则十一二人。其成员多为同年级、同年龄学生，且有类似的待解决的心理困扰。小组辅导的适用条件是：学生的心理问题与人际交往有关，且小组成员愿意在团体中探讨他们的问题。一个小组通常要活动十多次，每次时间为一课时。小组辅导兼有班级辅导与个别辅导的优点，是一种很有发展潜力的心理健康教育方式。上海市一些中小学在开展心理健康教育时以班级为管理单位，但活动的基本组织形式是小组。小组由学生自愿结合形成，推举热心于活动、态度热情、工作负责的同学当组长，每学期活动七八次，取得了较好的效果。
应该强调指出的是，组织学生参加各种社会实践活动是学校心理健康教育的一条重要途径。
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